花垣确立了“政府主导、企业主体、市场运作、依法推进”的整合总原则。由湖南金石勘查有限公司设计，并充分听取民意，分别制定了《锰矿区矿产资源开发整合方案》与《铅锌矿区矿产资源开发整合方案》。把锰矿山31个采矿权整合为5个，铅锌矿山36个采区矿硐全部实行实质性整合，确保实现“一个整合区域（采区）、一个采矿权、一个法人主体、一套相适应的开发利用方案”，达到“统一规划设计、统一组织生产、统一产品销售、统一财务核算、统一安全生产管理”。强力推行“八个一律”：未取得“三证一照”的一律不准生产；从业人员未经培训合格的一律不准生产。

按照“典型引路、重点突破、分类推进、全面铺开”的思路，将基础条件好、业主积极性高的矿区作为样板，集中时间、集中精力率先突破，及时召开了3次经验交流会和4次推进会，示范带动了全县的实质性进展。同时，引导企业按照“尊重历史，兼顾公平”原则，“一区一策”，采取收购兼并、股份合作等办法和灵活合理的资产评估方式确定股权，大并小，优并劣。矿山面貌焕然一新。锰矿山已由31个采矿权整合为5个，其中4个区域已全面完成整治整合，合法生产；铅锌矿山36个采区已完成整合，其中15个采区通过省、州安监部门验收。1227个矿硐中，除按设计方案保留204个外，其余的全部永久性关闭。全县74座尾矿库进行了整改设计，其中40座尾矿库取得安全生产许可证，达到五级以上标准化要求。全县电解锰企业累计投入整改资金2亿元治理锰污染，除1家关闭外，其余13家全部通过验收。

2011年，矿山上访批次和人次比2010年分别下降32.2%和27%。全省公众安全感民调排名中，花垣由第116位上升到第71位。被公安部、省综治委等挂牌整治和警示的4块“黑牌”全部摘除花垣在推进整治整合的同时，同步推进矿产品加工企业的战略重组，优化资源配置，由“治标”向“治本”转变。

县财政每年安排科技引导资金和工业专项资金，支持企业科技创新和实施技术改造。2011年，全县投入技改资金7.5亿元，比上年增长31.6%；今年一季度，完成技改投入1.51亿元，同比增长19.4%。县政府先后与中南大学等院校签订了全面合作框架协议，13户工业企业与25家科研院所签订了技术合作协议。

推进电解锰冶炼企业横向整合。由全县8家电解锰企业联合出资1.7亿元，组建了湖南东方矿业有限责任公司，与国家环科院签约转让3项专利新技术，采用国际一流新技术、新工艺、新设备，建设年产15万吨电解锰及精深加工项目，成为全国同类行业整合典范。推进电解锌企业纵向整合。

太丰集团控股、参股14个铅锌采区，产能达到10.5万吨，成为自治州第一家符合国家产业政策的电解锌企业。整合后的三立集团现有产能达14万吨，正着力打造32万吨“采、选、冶、精深加工、综合回收”一体化的大型锌业集团。

以白藜芦醇为代表的生物制药、高纯石英砂为代表的新材料等新兴产业正在兴起，其中年产5000吨高纯石英砂一期生产线已建成试产，亿粒白藜芦醇生产线近日已动工兴建。成功挂牌“湖南省新材料产业湘西基地”、“湘西国家锰深加工高新技术产业化基地锰资源综合利用示范园”、“全国绿色能源建设示范县”。